生物质锅炉的脱硝方法有炉内脱硝和炉外脱硝两种。

1. 选择性催化还原脱硝技术(SCR):是一种未经任何改性，以NH3或尿素为还原剂，在金属催化作用下，不先被O2氧化，选择性地与NOx反应生成N2和H2O的锅炉本体。SCR脱硝技术是目前烟气脱硝效率最有效的处理技术，脱硝率可达95%以上，生物质燃料本身含有碱性物质，燃烧后形成粉煤灰进入SCR体系，吸附在催化剂表面或堵塞催化剂通道，也会造成催化剂失活。为了保证催化剂的安全运行，必须尽量减少烟气阻力。

2. 选择性非催化还原技术(SNCR):以加热炉为反应器，一般可获得30%~50%的NOx去除率。还原剂一般为氨、水和尿素，但氨属于危险化学品，一般采用尿素作为还原剂。SNCR技术是烟气脱硝的主要技术之一，反硝化成本低，工艺简单，但难以实现较高的脱硝效率。